ゲノム探偵

UNMの科学者は、次に何が起こるかについての手がかりのためにコロナウイルスのバリエーションを研究します

新規コロナウイルスとして -科学者にはSARS-CoV-2-として知られています-再現し、その遺伝暗号に変化が現れます。 時間の経過とともに蓄積されるこれらの変更は指紋のようなものであり、ウイルスがどこにいたのか、どこに向かっているのかについての手がかりの痕跡を残します。

ニューメキシコ大学の科学者であるダレルL.ディンウィディー博士とダリルドマン博士は 事件を解決しようとするゲノム探偵の役割を果たしています。

彼らは、病気を追跡しようとしている研究大学と公衆衛生部門の新しく形成された全国コンソーシアムの一部です。 SARS-CoV-2 SPHERESと呼ばれるこのプログラムは、ウイルスに関する重要な情報をプールする方法として、米国疾病予防管理センターの支部である国立新興感染症センターによって後援されています。

UNM小児科の助教授であるDinwiddieは、過去数週間にわたって、ニューメキシコ大学保健省とワイオミング公衆衛生研究所から入手した数百のコロナウイルスサンプルを分子ゲノミクス研究室でシーケンスしています。

「私たちは最近、ニューメキシコからの最初の48のゲノムを完成させました」と彼は言います。 「州内の最初の感染の大部分が世界中からの旅行関連であったという強い兆候があります。」

Dinwiddieは、内科の助教授であるDomman、PhDと分析に協力してきました。 「彼は私たちがゲノム疫学と呼ぶ多くのことをしている」とディンウィディーは言い、ドーマンは世界中でコレラが発生した後の経験があると付け加えた。 「私たちはSARS-CoV-2を調査するために非常に類似した方法を使用しています。」

新しいコロナウイルスゲノムは、RNAと呼ばれる分子の鎖にコードされています。 鎖内のヌクレオチド配列のわずかな変化は、あるウイルスサンプルが別のウイルスサンプルとどれほど密接に関連しているかについての情報を提供します。

DinwiddieやDommanのような科学者は、ウイルスの家系図を作成するためにこれらのサンプルのライブラリを構築することに熱心に取り組んでいます。

ニューメキシコで収集されたサンプルの予備分析は、州へのウイルスの複数の導入があったことを示唆しており、これは海外または国内を旅行した人々の間の症例の初期の報告と一致しています。

「初期のゲノム解析から、サンプルの大部分はヨーロッパやニューヨークから出てきた菌株により類似していると言うこともできます」と彼は言います。 「中国のものと密接に関連しているものはあまり見られません。」

ウイルス生殖のゲノム変異は自然なプロセスです。 「SARS-CoV-2Sの場合、ゲノム変化の速度はかなり安定しています」とDinwiddie氏は言います。 「私たちはそれがどれほど速く変化するかを知っています。その情報に基づいて、さまざまなサンプルがどれだけ前に戻ったかについて予測することができます。」

ウイルスサンプルは、コロナウイルス感染が陽性であるとテストされた患者から収集された鼻腔スワブから採取されます。 それらはバイオセーフティ手順を使用して処理され、感染性がなくなるように不活化されます、とDinwiddieは言います。