癌における代謝経路の予後的価値と共発現パターン

Dan Zhang、Yan Guo、Ni Xie | December 29, 2020
背景:異常な代謝経路は、癌の特徴のXNUMXつと見なされてきました。 その間
さまざまな癌で多くの代謝経路が研究されており、代謝経路間の直接的なつながり
遺伝子発現と癌の予後は確立されていません。
結果:最近開発されたXNUMXつのバイオインフォマティクス分析手法を使用して、
29の癌における最大33の代謝経路の代謝経路の発現と腫瘍対正常な調節不全
タイプ。 結果は、腫瘍内の代謝遺伝子発現の増加が癌の予後不良に対応することを示しています。
メタディファレンシャル共発現分析により、有意なグローバル共発現を伴うXNUMXつの代謝経路が特定されました
腫瘍と正常なサンプル間のネットワーク障害。 代謝経路の差次的発現分析
また、対になった腫瘍と正常なサンプルの間で強い遺伝子発現障害を示しました。
結論:まとめると、これらの結果は、代謝経路の遺伝子発現が
腫瘍形成後に乱れた。 腫瘍内では、腫瘍細胞が活性化するために多くの代謝経路がアップレギュレートされます
細胞分裂に必要なエネルギーを維持するための対応する代謝。
キーワード:代謝経路、メタ共発現分析、遺伝子発現複合スコア、癌

グローバルな自己接合性は、がんのリスク、変異の特徴、および予後に関連しています

Limin Jiang、Fei Guo、Jijun Tang、Shuguan Leng、Scott Ness、Fei Ye、Huining Kang、David C. Samuels、Yan Guo | December 04, 2020
ホモ接合性の実行という形でのグローバルな自己接合性は、さまざまな病気に関連しています。 この研究では、グローバルな自己接合性の代替尺度であるヘテロ接合性比を使用して、がんのリスクを評価します。 私たちの分析は、ヘテロ接合性の比率とさまざまな癌の種類との間に強力で一貫した関連性を示しています。 さらなる分析により、ヘテロ接合性比と突然変異の兆候および癌の予後との潜在的な関係が明らかになります。