発見のためのロードマップ

UNM研究者が国際ヒトゲノム研究を主導

新しい研究によると、ヒトゲノムの40％近くがほとんど未踏のままであり、これが新薬療法の探索を劇的に妨げる可能性があります。

科学者は、すでに比較的よく説明されているゲノムの領域を照会することで成功し、資金を調達できる可能性が高いことを科学者が知っているため、研究の不足は自己永続的である傾向があります。

問題を解決するための最初のステップとして、米国とヨーロッパの科学者のチームは、遺伝子（およびそれらがコードするタンパク質）がどれほど広範囲に研究されたかに従ってゲノムを分類するための洗練された方法を提案しました。 新しい分類スキームは、これらのタンパク質が一連の新しい薬物療法の標的である可能性が高いかどうかを確認するために必要な手順も示唆しています。

この作業は、国立衛生研究所の共通基金イニシアチブである、Illuminating the Druggable Genome（IDG）プロジェクトの一環として実施されました。 調査結果は「ヒトゲノムにおける未踏の治療機会、「23年2018月XNUMX日号に掲載されました。 ネイチャーレビュードラッグディスカバリー.

ニューメキシコ大学内科の翻訳情報学部の教授兼チーフである筆頭著者のTudorOprea、MD、PhDは、次のように述べています。 「この研究はその状況に注目を集めています。私たちは科学者や資金提供者に未知のものを探求することを奨励したいと思っています。」

Opreaは、IDGナレッジマネジメントセンターの研究者チームを率いて、ヒトタンパク質のターゲット開発レベル（TDL）を追跡するために、ゲノム、プロテオミクス、化学、および疾患に関連するさまざまなデータの徹底的なレビューを行いました。

研究者らは、ヒトタンパク質をXNUMXつのTDLカテゴリーのXNUMXつにグループ化することを提案しました。

• T_CLIN （「臨床」の略）は、承認された薬剤との相互作用が既知であり、作用機序が特定されている、最も研究されているタンパク質を表します。 これらは、ヒトのプロテオームのわずか3パーセントに相当します。
• T_化学 （「化学」の場合）比較的高い効力で小分子に結合することが知られているタンパク質が含まれます。 このグループはプロテオームの6％を占めています。
• T_バイオ （生物学）とは、疾患との関連性が実験的に証明されており、その構造と機能についてある程度理解されているが、創薬ターゲットとして十分に開発されていないタンパク質を指します。 プロテオームの約53％がこのカテゴリーに属しています。
• T_暗い （「暗い」ゲノムを指す）には、他のカテゴリのいずれにも含めるための基準を満たさないすべてのタンパク質が含まれます。「これらは、現在の知識が最も少なく、特定の分子の数が少ないタンパク質です。利用可能なプローブ」と著者は述べた。「いくつかは、創薬可能なヒトゲノム内の未踏の機会を表しています。」これらのタンパク質は、プロテオームの38パーセントを占めています。

著者らは、研究がしばしば「人工的な区別」に基づいており、問題が臓器や病気によって分離されているため、ダークゲノムを研究するための資金が不足していると述べています。 「この区別は、文脈に固有の方法ではあるが、臓器に関係なく同じ遺伝子と経路の間の相互作用を観察する可能性が高いため、本質的に崩壊します。」

彼らが提案した分類スキームは、「さまざまなターゲットに対する科学と創薬の取り組みの焦点（またはその欠如）を強調する、人間のターゲットを分割する便利な方法を提供します」。

Opreaは、小分子が現在知られている薬物標的が人間のプロテオームの約10％にすぎないという事実は、「人間生物学を完全に理解していない程度を強調しています。やるべきことはもっとたくさんあります。

背景：

ナレッジマネジメントセンターには、NIH National Center for Advancing Translational Sciences、ニューメキシコ大学、マイアミ大学、コペンハーゲン大学、European Bioinformatics Institute、およびシナイ山のIcahn School ofMedicineの研究者が含まれています。 この論文の他の協力者は、イェール大学、ノースカロライナ大学、カリフォルニア大学サンフランシスコ校、ベイラー医科大学、チューリッヒ大学、およびIQVIAとアストラゼネカからです。